Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms