Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpb2-203ENSMUST00000107204 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC156273.1-201ENSMUST00000214570 2762 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pus3-201ENSMUST00000034615 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Fmo6-201ENSMUST00000178465 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mirg-212ENSMUST00000183144 3797 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Depdc5-201ENSMUST00000049780 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pex5l-209ENSMUST00000193289 3526 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd6b-201ENSMUST00000028103 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13198-201ENSMUST00000119322 826 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4208-201ENSMUST00000189802 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC123692.2-201ENSMUST00000226272 342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhae-201ENSMUST00000067664 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Spire1-207ENSMUST00000224799 2059 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna2-202ENSMUST00000196403 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lpl-201ENSMUST00000015712 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Nfam1-201ENSMUST00000023076 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms