Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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