Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc39dQ0VF76 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms