Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms