Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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