Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SbdsP70122 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms