Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Rps29P62274 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms