Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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