Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrprbP47758 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms