Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Mmp9P41245 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms