Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rom1P32958 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rom1P32958 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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