Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms