Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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