Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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