Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms