Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms