Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 B020018J22Rik-201ENSMUST00000223085 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrfQ9JM73 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm10118-201ENSMUST00000079279 2569 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm38024-201ENSMUST00000192338 2532 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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