Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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