Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms