Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms