Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71Q8VEG0 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms