Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CipcQ8R0W1 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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