Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms