Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Paf1Q8K2T8 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms