Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Snx17Q8BVL3 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms