Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Actn1Q7TPR4 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms