Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc18Q640L5 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms