Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Hoxa13Q62424 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxa13Q62424 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms