Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms