Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms