Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Q3U6N9 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Q3U6N9 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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