Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Usp39Q3TIX9 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Usp39Q3TIX9 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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