Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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