Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms