Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SgcdP82347 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SgcdP82347 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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