Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms