Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.6 ms