Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprkP35822 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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