Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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