Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
P10404 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
P10404 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
P10404 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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