Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TtrP07309 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TtrP07309 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms