Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PdgfrbP05622 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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