Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms