Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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H2-M1F7CXU4 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-M1F7CXU4 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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