Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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PtprbB2RU80 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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