Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Grik3B1AS29 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms