Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms