Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms