Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms